Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms