Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms