Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms