Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms