Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf1bP97358 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms