Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms