Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3bp1P55194 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3bp1P55194 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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