Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtlP38585 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtlP38585 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms