Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hes1P35428 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms