Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp4P35123 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp4P35123 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms