Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms