Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Psmb9P28076 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms