Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde6aP27664 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde6aP27664 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde6aP27664 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde6aP27664 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde6aP27664 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde6aP27664 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde6aP27664 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms