Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms