Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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SftpcP21841 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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SftpcP21841 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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SftpcP21841 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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SftpcP21841 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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SftpcP21841 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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SftpcP21841 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SftpcP21841 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SftpcP21841 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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