Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18526 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18526 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18526 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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