Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18525 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18525 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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