Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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