Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfdp1O88271 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfdp1O88271 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms