Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Sp100O35892 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Sp100O35892 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sp100O35892 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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