Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Timm44O35857 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms