Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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