Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms