Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MttpO08601 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MttpO08601 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MttpO08601 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MttpO08601 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms