Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms