Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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