Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20828J3KMI7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms