Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh8D3Z6W3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms