Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb8B1AY40 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms