Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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