Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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