Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17190V9GX38 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms