Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms