Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms