Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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SacsQ9JLC8 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SacsQ9JLC8 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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