Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Mrpl39Q9JKF7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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