Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp4Q9DBY0 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms