Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Subh2bvQ9D9Z7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Subh2bvQ9D9Z7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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