Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q9D7E4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms