Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Shisa9Q9CZN4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms