Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snw1Q9CSN1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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