Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms