Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms