Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PccbQ99MN9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PccbQ99MN9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PccbQ99MN9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PccbQ99MN9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PccbQ99MN9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PccbQ99MN9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PccbQ99MN9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PccbQ99MN9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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