Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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