Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atg4aQ8C9S8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Atg4aQ8C9S8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg4aQ8C9S8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg4aQ8C9S8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg4aQ8C9S8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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