Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp20Q8C6M1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp20Q8C6M1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp20Q8C6M1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp20Q8C6M1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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