Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hdac7Q8C2B3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hdac7Q8C2B3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms