Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms