Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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